1. Plan Nacional de Desarrollo 2013-2018.

2. Programa Sectorial de Salud 2013-2018

3. Programa del Sistema Nacional para la Cruzada Contra el Hambre

4. Programa de Calidad Efectiva en Servicios de Salud PROCESS

5. Programa Nacional de Protección Civil 2014-2018

6. Plan Maestro de Infraestructura Física en Salud.

7. Plan de acción sobre salud mental 2013-2020

8. Plan Indígena 2014-2018

9. CAUSES 2016

10. Programa Nacional de Infraestructura 2014-2018

11. Programa Nacional de Asistencia Social 2014-2018

12. Programa Nacional para la Igualdad y No Discriminación 2014-2018

13. Programa Nacional de Derechos Humanos 2014-2018

14. Programa Especial de los Pueblos Indígenas 2014-2018

15. Programa de Acción Específico 2007-2012; Gestión de Equipo Médico.

16. Programa de Acción Específico 2013-2018; Entornos y Comunidades Saludables.
17. Programa de Acción Específico 2007-2012; Desarrollo de Guías de Práctica Clínica.

18. Programa de Acción Específico 2013-2018; Salud Mental.

19. Programa de Acción Específico 2013-2018; Comisión Federal para la Protección Contra Riesgos Sanitarios.

20. Programa Institucional de la Secretaría de Salud 2007-2012.

21. Programa de Acción Específico, Fortalecimiento de las Redes de Servicios de Salud en Municipios de Menor Índice de Desarrollo Humano 2007-2012.

22. Programa de Acción Específico, para la Salud y Determinantes Sociales 2013-2018

23. Programa de Acción Especifico, Evaluación y Gestión de tecnologías en Salud 2013-2018

24. Programa de Acción Específico Salud Materna y Perinatal

25. Programa de Acción Específico, Evaluación del Desempeño

26. Programa de Acción Específico, Consolidación de la Atención y la Investigación de las Quejas Médicas 2013-2018.

27. Programa de Acción Específico, Seguridad de la Sangre y de las células Troncales

28. Programa de Acción Específico; Estrategia Nacional para la Consolidación de la Calidad en los Establecimientos y Servicios de Atención Médica 2013-2018.

29. Programa de Acción Específico; Atención del Envejecimiento 2013-2018

30. Programa de Acción Específico; Eliminación de la Lepra 2013-2018

31. Programa de Acción Específico; Prevención y Control de la diabetes Mellitus 2013-2018

32. Programa de Acción Específico; Prevención y Control de la Obecidad y Riesgo Cardiovascular 2013-2018

33. Programa de Acción Específico; Prevención y Control de la Tuberculosis 2013-2018

34. Programa de Acción Específico; Prevención y Control del Dengue 2013-2018

35. Programa de Acción Específico; Prevención y Control de las Enfermedades Respiratorias e Influenza 2013-2018

36. Programa de Acción Específico; Prevención de Enfermedades Diarreicas Agudas y Cólera 2013-2018
37. Programa de Acción Específico; Atención de Urgencias epidemiológicas y Desastres 2013-2018

38. Programa de Acción Específico; Eliminación de la Oncocercosis 2013-2018

39. Programa de Acción Específico; Prevención y Control de la Intoxicación por Picadura de Alacrán 2013-2018

40. Programa de Acción Específico; Prevención y Control de las Leishmaniasis 2013-2018

41. Programa de Acción Específico; Prevención y Control del Paludismo 2013-2018

42. Programa de Acción Específico; Prevención y Control de la Brucelosis 2013-2018

43. Programa de Acción Específico; Prevención y Control de la Enfermedad de Chagas 2013-2018

44. Programa de Acción Específico; Prevención y Control de las Rickettsiosis 2013-2018

45. Programa de Acción Específico; Prevención y Control de la Rabia Humana 2013-2018

46. Programa de Acción Específico; Prevención, Detección y Control de los Problemas de Salud Bucal 2013-2018

47. Programa de Acción Específico; Estrategia Nacional para la Consolidación de la Calidad en los Establecimientos y Servicios de Atención Médica.

48. Programa de Acción Específico; Evaluación y Gestión de Tecnologías en Salud.

49. Programa Nacional para la Igualdad de Oportunidades y No Discriminación contra las mujeres.

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